More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  100 
 
 		 272 aa  525  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 231 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  44.05 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  47.64 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  45.09 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  47.72 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  48.92 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  43.57 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  39.69 
 
 		 203 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  44.83 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  45.93 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  38.31 
 
 		 202 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  44.76 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  38.31 
 
 		 202 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  40.28 
 
 		 206 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  39.49 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  49.31 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  37.68 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  40 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  35.71 
 
 		 209 aa  127  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  41.62 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 210 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  40.82 
 
 		 198 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  44.13 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  40.5 
 
 		 198 aa  125  8.000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  45.78 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  38.54 
 
 		 185 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  44.56 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  39.02 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  39.07 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  40.1 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 184 aa  122  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  38.1 
 
 		 198 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  48.54 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  42.02 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  38.97 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 212 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  40.5 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  43.94 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 208 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  39.44 
 
 		 213 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  38.97 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  40 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  40 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  39.53 
 
 		 213 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  40.85 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  42.44 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  39.49 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  39.49 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  39.49 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 197 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 198 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 198 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 195 aa  118  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  40 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  44.44 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  39.23 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  38.46 
 
 		 221 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  39.71 
 
 		 199 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  35.42 
 
 		 191 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  40 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  38.74 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  38.62 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  39.47 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  40.61 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  36.6 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  45.73 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  37.93 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  41.04 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  36.7 
 
 		 198 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  35.9 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  39.06 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  38.14 
 
 		 206 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  44.95 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  40 
 
 		 211 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  39.49 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>