More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1022 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  49.1 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  37.73 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  39.07 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  36.56 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  35.94 
 
 		 221 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  35.07 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  38.16 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  36.67 
 
 		 232 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  35.21 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  35.16 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  36.88 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  36.9 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  35.27 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  36.53 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  31.72 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  34.57 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  29.23 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  32.97 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  33.82 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  32.22 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  34.06 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  34.8 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  31.27 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  32.17 
 
 		 218 aa  99  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  28.36 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  35.44 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  29.35 
 
 		 211 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  31.27 
 
 		 201 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  33.72 
 
 		 209 aa  96.3  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  33.72 
 
 		 209 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  29.35 
 
 		 211 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  29.35 
 
 		 206 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  31.27 
 
 		 201 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  29.48 
 
 		 228 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  30.51 
 
 		 209 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  32.95 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  24.26 
 
 		 197 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  31.88 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  26.91 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  29.85 
 
 		 212 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  29.85 
 
 		 212 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 206 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  31.97 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  30.86 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  29.24 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  30.86 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  27.61 
 
 		 209 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  33.58 
 
 		 257 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  29.73 
 
 		 208 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  30.48 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  28.94 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  27.51 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  30.86 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  30.4 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  28 
 
 		 213 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  28.78 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  30.55 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  28.06 
 
 		 220 aa  85.5  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  28.06 
 
 		 220 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  28.95 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  30.12 
 
 		 214 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  30.12 
 
 		 214 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  30.15 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  30.12 
 
 		 214 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  29.74 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  31.07 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  28.73 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  28.16 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  28.21 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  32.22 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  29.04 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  28.57 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  31.4 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  30.62 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  28.04 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  29.34 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  26.44 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  27.7 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  26.45 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  28.19 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  26.07 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  33.83 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  29.73 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  29.34 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  29.74 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  28.19 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  28.06 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  27.9 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  28.96 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  29.74 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  28.19 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  30.26 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  31.34 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  28.96 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  30.11 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  31.85 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  25.91 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  29.34 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  29.34 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>