More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  60.62 
 
 		 303 aa  258  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  60.36 
 
 		 279 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  56.14 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  52.04 
 
 		 260 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 221 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  56.62 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  57.42 
 
 		 273 aa  188  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  51.54 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  47.86 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  54.26 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  44.44 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  48.51 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  45.78 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  43.81 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  41.48 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  42.79 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 206 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  39.37 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  36.88 
 
 		 279 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  40.27 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  35.48 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  37.35 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  39.3 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  38.94 
 
 		 210 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40.18 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40.18 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  40.58 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  37.1 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  40.83 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  37.1 
 
 		 224 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  39.73 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  34.6 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  35.89 
 
 		 211 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  36.23 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  36.17 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  37.25 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  31.31 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  34.35 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  36.95 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  42.03 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  36.99 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  33.19 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  35.12 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  35.12 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  39.05 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  34.26 
 
 		 217 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  34.58 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  34.12 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  34.25 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  36.36 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  39.02 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  37.09 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  30.32 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  35.12 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  35.32 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  35.48 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  34.25 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  31.4 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  34.8 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  35.45 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  35.42 
 
 		 229 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  37.31 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000218298  unclonable  0.00000000118399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  33.18 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  34.47 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  34.95 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  36.54 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  36.16 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  33.65 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  34.47 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0591  Ribonuclease H  39.71 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  35.29 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  33.5 
 
 		 221 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  36.97 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  35.27 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  37.44 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  36.84 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  37.02 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 209 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 209 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  39.45 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  38.42 
 
 		 262 aa  101  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  38.92 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  30 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  36.49 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  36.95 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  39.42 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  33.98 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  34.48 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  36.95 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  30.24 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>