More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0699 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  48.22 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  50 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000218298  unclonable  0.00000000118399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.37 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  47.67 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  40.09 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  40.27 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  37.94 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  41.07 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  40.09 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  43.08 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  39.58 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  39.58 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  37.73 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  41.74 
 
 		 308 aa  151  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  40.18 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 206 aa  148  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  39.68 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  41.63 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  39.72 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  41.63 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  41.63 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 201 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  46.41 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  42.47 
 
 		 197 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  41.15 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 202 aa  142  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 202 aa  142  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.98 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  44 
 
 		 213 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  41.33 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  43.62 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  37.27 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  46.37 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  37.27 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  39.7 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  43.98 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  43.89 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  44.94 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  43.98 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  43.82 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  42.35 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  41.58 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  45.51 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  43.26 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  45.6 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  42.5 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  41.01 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  40.21 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 217 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  43.26 
 
 		 207 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  34.8 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.37 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  37.56 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>