More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0591 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0591  Ribonuclease H  100 
 
 		 200 aa  381  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  50.79 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1454  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  42.93 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  37.06 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  44.74 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  46.15 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  43.85 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  43.88 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  43.52 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  44.79 
 
 		 240 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  39.61 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  45.64 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  42.79 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  43.37 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  43.92 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  45.95 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  42.93 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.35 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  43.37 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  40 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  44.67 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  42.47 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  44.15 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  45.26 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  44.97 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  43.09 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 213 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  40.4 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  41.15 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  40.74 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  41.97 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  44.97 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  40.84 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  43.92 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  40.2 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  45.96 
 
 		 269 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  41.08 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  38.66 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  38.22 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  43.92 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  41.45 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  41.5 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  42.27 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  37.62 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  39.71 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  41.55 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  37.56 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  40 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>