More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1676 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  41.54 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  41.92 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  40 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  40.93 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  39.27 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  36.55 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  43.16 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  43.68 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  41.88 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  38.74 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  41.58 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  44.79 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  41.3 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  42.42 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  38.19 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 257 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  38.66 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  38.66 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  40 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  40 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  37.82 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  36.84 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  38.34 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  37.7 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  38.22 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  38.22 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  38.22 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  39.39 
 
 		 229 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  39.04 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  38.74 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  43.09 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  38.86 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  37.89 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  37.7 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  35.9 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  39.5 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  41.54 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  40 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  38.5 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  40.43 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  36.1 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  39.58 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  39.47 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  39.47 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  39.47 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  41.09 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  37.43 
 
 		 249 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  38.34 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  37.7 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  37.37 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  37.7 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  36.65 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  41.95 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  37.44 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  41.27 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  40 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  39.47 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  39.47 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  35.15 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  36.84 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0577  RNase HII  38.95 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535045  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  35 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  37.82 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  41.95 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  39.47 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  38.1 
 
 		 268 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  37.37 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>