More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0342 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  69.94 
 
 		 183 aa  258  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  60.69 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  54.45 
 
 		 189 aa  204  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  57.95 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  54.4 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  57.89 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  58.48 
 
 		 191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  58.48 
 
 		 191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.16 
 
 		 202 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.16 
 
 		 202 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  44.89 
 
 		 256 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  42.08 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 203 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  43.82 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  41.57 
 
 		 217 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  41.48 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  41.01 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  41.34 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 235 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 257 aa  131  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  43.82 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  43.82 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  41.01 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 229 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 208 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  41.34 
 
 		 236 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  45.2 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  43.02 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 257 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  41.44 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  41.11 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  39.13 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  43.02 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 229 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  43.82 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 249 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  38.86 
 
 		 253 aa  128  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  41.01 
 
 		 211 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 219 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  39.66 
 
 		 214 aa  127  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  41.95 
 
 		 198 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  38.86 
 
 		 255 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  43.33 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  40 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  43.02 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  41.57 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  40.11 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 240 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  40.45 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  40 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 209 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  42.13 
 
 		 203 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  40.34 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  39.44 
 
 		 254 aa  124  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  41.34 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 279 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  40.34 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 209 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 212 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  37.99 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  39.58 
 
 		 245 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 267 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  40 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>