More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0430 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  100 
 
 		 185 aa  373  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  58.47 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  57.95 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  55.14 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  57.39 
 
 		 191 aa  197  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  57.06 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  58.52 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  58.52 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  54.8 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.2 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.2 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.2 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  42.05 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  41.48 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  37.04 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45.76 
 
 		 256 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  41.34 
 
 		 218 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  40.23 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  40.33 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  40.33 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  38.64 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  43.26 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  38.64 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 235 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  39.43 
 
 		 253 aa  130  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  37.64 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  42.63 
 
 		 242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  40.68 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  38.55 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  41.94 
 
 		 204 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  40.68 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  38.76 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  41.48 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  41.27 
 
 		 199 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  38.67 
 
 		 229 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  40.21 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  38.5 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  38.98 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  40.45 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 255 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  39.77 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  39.55 
 
 		 249 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  37.85 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  37.78 
 
 		 307 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 262 aa  124  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  40 
 
 		 277 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  38.54 
 
 		 272 aa  124  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  40.68 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  39.55 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  42.94 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  38.55 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>