More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11120 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  100 
 
 		 252 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  58.56 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  57.26 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  63.23 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  51.46 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  52.25 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  53.88 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  55.32 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  50.63 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  53.88 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  48.31 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  47.14 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  46.51 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  46.38 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  44.6 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  41.9 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  40 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  39.07 
 
 		 206 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  36.69 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  43.52 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  38.46 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  42.06 
 
 		 212 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  42.06 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  38.64 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  43.19 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  42.92 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  36.5 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  37.21 
 
 		 210 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  40.93 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  36.18 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  41.71 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  39.05 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  41.71 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  32.2 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  36.14 
 
 		 198 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  36.14 
 
 		 198 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  39.59 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  35.74 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  36.14 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  38.71 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  44.67 
 
 		 202 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  36.45 
 
 		 198 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  38.16 
 
 		 204 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  38.66 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  38.46 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  37.39 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  36.32 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  37.14 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  34.83 
 
 		 211 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  41.26 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  38.07 
 
 		 221 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  37.04 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  37.06 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  35.1 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  31.51 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  39.18 
 
 		 198 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  36.82 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  37.38 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  38.79 
 
 		 208 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  29.55 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  40 
 
 		 216 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  35.55 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  37.06 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  41.55 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  37.16 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  38.97 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  36.54 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  35.68 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  37.78 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  31.3 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  39.8 
 
 		 201 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  34.98 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  34.98 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  34.98 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  34.98 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  34.98 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  37.06 
 
 		 195 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  34.98 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  38.86 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  36.92 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  34.98 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  39.07 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  33.17 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  36.12 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  34.98 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>