More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6881 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  30.99 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  30.32 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  30.52 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  24.79 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  33.65 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  29.67 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  35.71 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  30.56 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  34.95 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  34.92 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  29.77 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  35.05 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  35.11 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  33.01 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  32.06 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  26.6 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  34.16 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  34.76 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  32.88 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  35.11 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  38.5 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  35.9 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  31.07 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  38.95 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  27.09 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  34.78 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  32.62 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  34.92 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  30.81 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  30.05 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  33.8 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  34.34 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  32.49 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  31.86 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  29.3 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  28.44 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  31.64 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  31.25 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  33.84 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  31.84 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  32.3 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  33.14 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  29.53 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  32.31 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13470  predicted protein  31.61 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  33.02 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  30.41 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  32.18 
 
 		 277 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  36.27 
 
 		 198 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  29.08 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  30.58 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  31.91 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  33.15 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  32.35 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  34.9 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  28.71 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  33.7 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  32.86 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  32.85 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  34.46 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  32.63 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  26.46 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  30.48 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  34.62 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  35.94 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  35.94 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  32.4 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  29.65 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  30.77 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  36 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  30.48 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  29.91 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1176  Ribonuclease H  33.67 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1460  ribonuclease HII  33.67 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  34.83 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  33.62 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  28.09 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  35.53 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  36.17 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  28.34 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  28.64 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  28.4 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  28.4 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  31.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  34.83 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  25.71 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  33.9 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  34.83 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  32.26 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  32.99 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  32.45 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>