More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0312 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  70.47 
 
 		 198 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  68.23 
 
 		 195 aa  275  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  64.71 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 209 aa  167  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  39.7 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  42.44 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  39.25 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  39.51 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  44.29 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  38.1 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  37.62 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  40 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  39.11 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  37.62 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  35.27 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  36.67 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  32.44 
 
 		 277 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  37.07 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  34.38 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  36.84 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  33.98 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  34.27 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  33.95 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  34.62 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  34.8 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  32.81 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  33.82 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  33.51 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  34.91 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  39.22 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  34.02 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  36.55 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  35.05 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  35.09 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  36.88 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  35.53 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  38.27 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  33.15 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  34.46 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  34.57 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  35.6 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  34.36 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  34.83 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  32.73 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  34.91 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  32.07 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  31.19 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  34.5 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  31.5 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  34.97 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  32.46 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  34.41 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  36.14 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  39.33 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  36.14 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  34.52 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  36.81 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  34.22 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  36.31 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  34.3 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  36.94 
 
 		 248 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  30.92 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  33.52 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  31.71 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  37.93 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  32.54 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  33.51 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  33.14 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  37.87 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  33.67 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  34.52 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  34.52 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  34.52 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>