275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1323 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  100 
 
 		 210 aa  411  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  62.28 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  63.03 
 
 		 234 aa  246  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  59.28 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  53.42 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  34.72 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  42.52 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  34.72 
 
 		 239 aa  147  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  34.72 
 
 		 239 aa  147  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  38.32 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  42.23 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  34.4 
 
 		 244 aa  141  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  38.32 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  37.44 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  36.97 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  39.44 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  30.4 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  40.82 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  32.34 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  36.36 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  30 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  37.06 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  32.84 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  36.84 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  37.36 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  32.14 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  32.14 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  31.66 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  25.93 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  36.89 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  31.03 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  33.73 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  34.12 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  28.63 
 
 		 347 aa  64.7  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  31.58 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  34.18 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  31.38 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  34.04 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  34.04 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  34.68 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  33.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  41.84 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  34.36 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  32.98 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  32.08 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  41.84 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  32.81 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  32.42 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  30.19 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  32.68 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  35.14 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  31.03 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  31.4 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  33.93 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  30.5 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  31.61 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  34.25 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  29.38 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  32.94 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  26.4 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  31.55 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  36.49 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  31.76 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  31.76 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  29.85 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  31.76 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  26.9 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  27.05 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  29.53 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  29.78 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  38.54 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  30.98 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  33.15 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  32.14 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  30 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  31.76 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  30.77 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  51.61 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  35.04 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  32.61 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  31.87 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  35.15 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  33.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  26.82 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  35.62 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>