More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1488 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  50.94 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  49.29 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  49.04 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  46.92 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  45.15 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  45.97 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  39.07 
 
 		 239 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  39.63 
 
 		 239 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  39.63 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  44.25 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  42.47 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  36.74 
 
 		 244 aa  153  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  37.45 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  41.63 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  40.57 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  40 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  42.5 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  40.39 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  36.32 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  35.32 
 
 		 260 aa  95.5  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  36.59 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  34.45 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  38.79 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  33.5 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  36.36 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  34.71 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  33 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  33 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  34.8 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  33 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  35.35 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  32.06 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  35.35 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  32.04 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  34.13 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  35.29 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  33.01 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  33 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  32.16 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  36.05 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  36.27 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  34.65 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  33 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  32.16 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  33 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  33.01 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  32.84 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  34 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  34 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  37.95 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  31.71 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  34 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  34.86 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  31.37 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  30.99 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  31.87 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  34.18 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  28.86 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  33.33 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  31.4 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  38.31 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  31.68 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  31.71 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  32.48 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  34.74 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  35.91 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  31.53 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  31.07 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  31.37 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  31.71 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  35.93 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  35.26 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  30.91 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  33.53 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  35.36 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  29.81 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  35.58 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  34.18 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  32.54 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  31.4 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  31.4 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  30.72 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>