284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0608 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  57.68 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  57.68 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  54.98 
 
 		 239 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  54.51 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  42.62 
 
 		 212 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  38.77 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  35.68 
 
 		 219 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  37.45 
 
 		 212 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 212 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  37 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  39.67 
 
 		 224 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  33.78 
 
 		 205 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  39.56 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  37.23 
 
 		 209 aa  135  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  34.75 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  35.24 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  39.06 
 
 		 213 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  37.73 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  32.77 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 228 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  35.32 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  30.4 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  34.47 
 
 		 208 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  34.96 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  30.74 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  32.44 
 
 		 198 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  35.15 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  29.13 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  29.78 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  27.4 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  25 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  30.56 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  27.71 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  29.44 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  29.44 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  32.62 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  30.4 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  28.94 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  28.94 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  29.26 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  28.19 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  25.21 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  32.04 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  29.47 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  30.41 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  26.43 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  32.61 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  27.73 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  33.15 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  26.27 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  28.87 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  29.78 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  29.78 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  25.65 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  31.28 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  35.11 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  35.26 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  29.29 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  28.82 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  26.07 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0912  ribonuclease HII  27.4 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  27.92 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  31.63 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  27.96 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  26.92 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  31.72 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  29.22 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  27.13 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  30.48 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  25.66 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  28.24 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  25.64 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  25.74 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  25.64 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0923  ribonuclease H  26.64 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  32.46 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  30.5 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  25.64 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  25.45 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  27.68 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  27.36 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  26.69 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  32.47 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  28.72 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  32 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  24.24 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  32 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  26.73 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  30.51 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  32.67 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  26.86 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  24.24 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  27.42 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  25.37 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  25.37 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  28.28 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  27.96 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  31.41 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>