More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0923 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0923  ribonuclease H  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0912  ribonuclease HII  50 
 
 		 287 aa  261  8e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  47.67 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.8 
 
 		 203 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  41.42 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  42.15 
 
 		 213 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  39.42 
 
 		 199 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  43.31 
 
 		 217 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  44 
 
 		 207 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  41.6 
 
 		 207 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  44 
 
 		 207 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  43.6 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.8 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  43.6 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 201 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  39.52 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  43.04 
 
 		 207 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  42 
 
 		 218 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  41.2 
 
 		 201 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  38.59 
 
 		 207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  40.08 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  40.08 
 
 		 211 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  40.17 
 
 		 213 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  40.08 
 
 		 212 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  40.85 
 
 		 218 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  41.25 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  39.43 
 
 		 197 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  39.84 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  37.05 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  37.07 
 
 		 204 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  42.68 
 
 		 206 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  40.08 
 
 		 197 aa  142  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  41.6 
 
 		 199 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 208 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  38.82 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  35.74 
 
 		 253 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  41.28 
 
 		 206 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  38.43 
 
 		 206 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  40.5 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  38.61 
 
 		 236 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  40.51 
 
 		 202 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.42 
 
 		 240 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 202 aa  138  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  41 
 
 		 209 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 202 aa  138  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1362  ribonuclease HII  39.58 
 
 		 209 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  40.08 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  41.95 
 
 		 213 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  38.56 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  39.67 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  36.33 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  38.56 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  38.14 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  38.56 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  37.71 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  39.67 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 212 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  36.65 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  39.67 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 209 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  38.56 
 
 		 198 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  38.56 
 
 		 198 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  39.41 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 210 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 210 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  37.76 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  37.71 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  38.98 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  38.98 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  36.59 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  39.41 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  38.98 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  36.82 
 
 		 209 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  38.98 
 
 		 198 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  38.56 
 
 		 198 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 198 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 197 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  37.65 
 
 		 214 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  36.25 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  38.56 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  38.25 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  36.67 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  37.87 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  36.86 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  40 
 
 		 206 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  37.6 
 
 		 210 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  38.96 
 
 		 207 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  37.89 
 
 		 217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>