117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0440 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  100 
 
 		 317 aa  637    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  32.18 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  28.89 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  30.28 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  33.33 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  26.73 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  32.39 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  31.63 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  33.17 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  33.49 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  28.07 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  28.07 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  29.39 
 
 		 236 aa  89.4  8e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  29.91 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  23.31 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  27.85 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  26.85 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  39.24 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  34.19 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  31.68 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  33.55 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  30.82 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  30.5 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  30.43 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  39.51 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  39.51 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  39.51 
 
 		 198 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  30.63 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  22.62 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  28.79 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  28.74 
 
 		 245 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  38.27 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  38.27 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  38.27 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  29.11 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  29.34 
 
 		 198 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  29.34 
 
 		 198 aa  52.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  27.91 
 
 		 219 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  27.88 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  28.99 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  37.04 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  37.04 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  37.04 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  25.11 
 
 		 224 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  29.94 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  27.76 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  32.92 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  29.01 
 
 		 142 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  38.2 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  23.17 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  28.14 
 
 		 198 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  38.55 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  34.48 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  26.11 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  28.42 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  25.6 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  28.75 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  28.14 
 
 		 198 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  32.73 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  28.27 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  26.92 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  34.57 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  34.57 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  32.56 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  34.57 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  34.57 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  34.57 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  31.43 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  28.66 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  28.66 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  41.86 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  26.32 
 
 		 219 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  26.92 
 
 		 195 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 197 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  33.73 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 210 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  35.96 
 
 		 210 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  25.66 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  29.17 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  37.11 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  27.67 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  26.52 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13470  predicted protein  25.71 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  30.29 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  24.18 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  25.57 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  23.3 
 
 		 198 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1362  ribonuclease HII  34.83 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  28.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>