58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0820 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  60 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  45.4 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  45.69 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  45.86 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  45.14 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  45.69 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  45.14 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  45.14 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  44.76 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  45.4 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  45.16 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  44.74 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  38.14 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  38.06 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  38.06 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  36.63 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  35.48 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  37.82 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  50.75 
 
 		 142 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  41.85 
 
 		 177 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  33.17 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  35.74 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  32.49 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  26.36 
 
 		 236 aa  93.2  5e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  27.6 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  30.45 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  27.27 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  29.34 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  24.31 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  31.71 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  29.63 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  25.44 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  28.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  29.61 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  28.9 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  30.05 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  26.4 
 
 		 195 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  28.48 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  24.49 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  29.41 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  27.27 
 
 		 272 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  27.27 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  26.4 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  32.32 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  33.85 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  27.72 
 
 		 393 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  37.93 
 
 		 205 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  22.91 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  28.66 
 
 		 203 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  33.53 
 
 		 222 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  39.44 
 
 		 249 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  29.95 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  28.74 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>