39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1740 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  63.97 
 
 		 297 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  55.67 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  39.35 
 
 		 338 aa  188  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  41.13 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  40.36 
 
 		 332 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  37.94 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  40.36 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  40.43 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  40.43 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  37.94 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  40 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  40.4 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  40.36 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  37.82 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  38.64 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  37.03 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  37.03 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  37.77 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  28.89 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  40.56 
 
 		 177 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 142 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  31.34 
 
 		 236 aa  89.7  5e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  33.33 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  28.15 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  27 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  27.27 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  29.82 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  23.12 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  26.67 
 
 		 209 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  25.45 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  25.84 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  26.24 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  27.18 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  25 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  23.62 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  25 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  28.5 
 
 		 215 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  24.66 
 
 		 212 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>