49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0723 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  100 
 
 		 308 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  68.2 
 
 		 312 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  68.2 
 
 		 312 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  45.39 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  44.25 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  43.21 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  43.55 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  43.21 
 
 		 311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  43.21 
 
 		 311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  42.86 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  42.86 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  42.51 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  42.86 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  38.14 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  37.79 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  38.64 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  37.28 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  34.97 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  36.36 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  31.7 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  43.45 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  30.28 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  30.66 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  27.4 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  24.81 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  27.69 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  26.25 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  28.39 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  29.23 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  25.58 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  25.58 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  29.88 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  31.07 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 224 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  31.52 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  43.4 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  26.26 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  23.75 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  46.34 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  34.65 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  30.06 
 
 		 198 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  41.07 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  47.62 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  24.73 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  27.14 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  25.66 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  23.44 
 
 		 209 aa  42.4  0.01  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>