54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2097 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  100 
 
 		 334 aa  678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  39.86 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  38.03 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  36.19 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  34.35 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  35.21 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  35.21 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  35.21 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  38.16 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  38.16 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  38.16 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  37.68 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  33.97 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  33.7 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  27.41 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  30.11 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  29.48 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  29.48 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  29.61 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  31.72 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  30.91 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  33.01 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  25.97 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  30.34 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  28.52 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  23.17 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  41.13 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  30 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  30.88 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  28.65 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  29.41 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  40.54 
 
 		 211 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  49.09 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  40.85 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  27.51 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  27.11 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  27.01 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  28.09 
 
 		 219 aa  46.2  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  26.9 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  40.74 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  26.2 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  28.14 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  43.64 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  26.11 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  30.43 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  28.25 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  51.79 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  34.23 
 
 		 202 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  24.85 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  27.22 
 
 		 219 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  28.57 
 
 		 208 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 196 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  31.19 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>