53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2636 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  60 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  48.53 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  46.79 
 
 		 312 aa  288  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  46.95 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  46.95 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  46.62 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  46.62 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  46.62 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  46.3 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  46.3 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  45.98 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  41.72 
 
 		 303 aa  230  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  37.5 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  37.5 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  40.4 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  41.42 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  38.56 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  37.28 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  55.97 
 
 		 142 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  39.2 
 
 		 177 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  28.64 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  34.23 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  28.84 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  27.67 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  35.89 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  29.74 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  29.82 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  31.28 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  25.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  26.95 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  29.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  26.18 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  22.8 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  25.52 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  28.14 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  28.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  29.44 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  26.59 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  27.62 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  23.28 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  26.79 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  29.68 
 
 		 232 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  24.23 
 
 		 224 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  22.96 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  26.7 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  29.38 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  23.66 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  25.95 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  26.9 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  23.2 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  41.07 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  30.97 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>