98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0022 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  100 
 
 		 318 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  37.97 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  42.51 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  36.25 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  35.74 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  33.74 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  36.32 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  32.86 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  32.86 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  34.39 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  34.39 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  30.66 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  33.94 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  33.94 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  33.94 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  33.94 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  33.94 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  33.48 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  33.48 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  32.14 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  29.91 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  30.09 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  32.9 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  29.58 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  27.07 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  31.02 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  31.09 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  32.54 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  32.93 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  27.78 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  41.33 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  30.93 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  30.53 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  25.5 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  24.39 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  31.06 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  21.71 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  26.15 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  33.54 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  32.32 
 
 		 198 aa  49.7  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  32.32 
 
 		 198 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  33.63 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  28.91 
 
 		 208 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  32.32 
 
 		 198 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  25.63 
 
 		 195 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  25.63 
 
 		 195 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  37.08 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  32.61 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  25.31 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  30.52 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  38.36 
 
 		 190 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  27.09 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2028  ribonuclease HII  41.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  33.66 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  33.16 
 
 		 198 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 209 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  34.07 
 
 		 199 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  29.12 
 
 		 211 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  36.99 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  33.7 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  25.74 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  39.73 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  41.67 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  37.7 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  20.89 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  32.64 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  30.36 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  26.02 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  27.71 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  28.83 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  50 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  31.16 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  33.77 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  35.29 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2882  Ribonuclease H  37.33 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.507441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  33.87 
 
 		 213 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  36.59 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  41.1 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  41.1 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  23.23 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13470  predicted protein  47.27 
 
 		 194 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  27.84 
 
 		 211 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  31.37 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  35.66 
 
 		 202 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  31.16 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  31.73 
 
 		 213 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  35.62 
 
 		 212 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  34.04 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  32.02 
 
 		 188 aa  42.4  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>