41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0276 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  100 
 
 		 299 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  41.49 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  38.03 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  42.51 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  28.38 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  26.95 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  27.81 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  26.92 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  26.6 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  26.6 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  26.6 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  26.6 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  26.6 
 
 		 332 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  31.27 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  26.98 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  30.13 
 
 		 236 aa  92.4  8e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  27.6 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  26.86 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  26.86 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  27.69 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  30.92 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  27.07 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  23.31 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  28.15 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  25.29 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  28.84 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  25.13 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  29.63 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  27.45 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  26.8 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  28.66 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  26.14 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  26.59 
 
 		 213 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  30.23 
 
 		 211 aa  52.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  27.11 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  29.8 
 
 		 213 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  26.97 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  27.54 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  27.65 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  25.95 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>