99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1721 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  100 
 
 
303 aa  626  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  45.93 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  45.34 
 
 
311 aa  252  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  45.98 
 
 
311 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  45.34 
 
 
332 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  45.66 
 
 
311 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  45.66 
 
 
311 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  45.66 
 
 
311 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  45.66 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  45.02 
 
 
337 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  44.48 
 
 
338 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  44.74 
 
 
311 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  41.72 
 
 
301 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  40.99 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  35.95 
 
 
292 aa  168  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  36.05 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  36.05 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  34.97 
 
 
308 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  37.77 
 
 
296 aa  155  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  52.21 
 
 
142 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  41.67 
 
 
177 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  33.49 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  32.53 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  31.27 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  27.73 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  32.74 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  24.15 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  30.62 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  25.98 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  25.15 
 
 
212 aa  59.3  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  27.98 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  23 
 
 
211 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  23.12 
 
 
239 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  45.45 
 
 
209 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  25.77 
 
 
213 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  29.07 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  30.46 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  24.74 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  26.4 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  25.29 
 
 
205 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  23.74 
 
 
239 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  30.72 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  27.92 
 
 
211 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  25.84 
 
 
219 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  19.3 
 
 
208 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  30.11 
 
 
215 aa  48.9  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  28.65 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  26.67 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  29.52 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  27.98 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  29.52 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  25.73 
 
 
242 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  29.28 
 
 
250 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  26.4 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  25.73 
 
 
245 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  29.82 
 
 
203 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  45.65 
 
 
205 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  31.3 
 
 
209 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  26.7 
 
 
206 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  26.29 
 
 
209 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  29.81 
 
 
206 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  47.73 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  30.77 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  26.09 
 
 
210 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0708  ribonuclease HII/HIII  23.18 
 
 
424 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  30 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  28.85 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  30.36 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  28.57 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  28.24 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  31.21 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  26.58 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  27.12 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  45.45 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  24.56 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  28.02 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  23.32 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  24.18 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  31.58 
 
 
218 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  36.96 
 
 
209 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  25.3 
 
 
195 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  40 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  28 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  29.59 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  37.63 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  24.1 
 
 
195 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  27.43 
 
 
198 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  27.65 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  25.75 
 
 
219 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  26.83 
 
 
213 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  27.38 
 
 
214 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  26.9 
 
 
232 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13470  predicted protein  24.57 
 
 
194 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  28.05 
 
 
208 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  26.8 
 
 
203 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  29.28 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  29.17 
 
 
198 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  29.35 
 
 
196 aa  42.4  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  40.74 
 
 
199 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>