82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1221 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  100 
 
 		 312 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  100 
 
 		 312 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  68.2 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  44.56 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  45.7 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  44.21 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  43.86 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  43.01 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  43.01 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  43.86 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  43.86 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  43.51 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  42.81 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  38.06 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  39.48 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  37.5 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  37.03 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  36.05 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  37.28 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  45 
 
 		 142 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  42.25 
 
 		 177 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  34.27 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  32.86 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  28.07 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  26.86 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  30.43 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  29.1 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  22.46 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  30.05 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  30.05 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  27.94 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  26.47 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  27.27 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  30.85 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  26.9 
 
 		 232 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  29.51 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  28.25 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  27.98 
 
 		 206 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  32.12 
 
 		 198 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  30.73 
 
 		 197 aa  49.3  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  52.83 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  31.95 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  27.38 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  25.68 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  27.5 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  28.12 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  36.84 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  28.31 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 224 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  26.39 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  26.19 
 
 		 213 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  30 
 
 		 230 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  43.18 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  26.34 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  26.32 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  27.48 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  43.4 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  31.11 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  32.06 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  26.63 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  26.63 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  24.74 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  27.4 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  27.5 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  29.95 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  26.35 
 
 		 199 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  28.16 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  27.91 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  29.27 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  45.24 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  38.78 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  29.44 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0946  ribonuclease HII  29.32 
 
 		 209 aa  43.5  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  29.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  24.43 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  34.29 
 
 		 231 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  32.89 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  23.08 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  26.54 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  25.52 
 
 		 196 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  24.57 
 
 		 203 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>