57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4384 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  100 
 
 
312 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  94.21 
 
 
311 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  92.93 
 
 
311 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  93.25 
 
 
311 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  93.25 
 
 
337 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  92.93 
 
 
332 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  93.25 
 
 
311 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  92.28 
 
 
311 aa  597  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  93.25 
 
 
311 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  87.5 
 
 
338 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  90.91 
 
 
177 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  45.4 
 
 
311 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  93.57 
 
 
142 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  46.79 
 
 
301 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  45.93 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  44.56 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  44.56 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  44.25 
 
 
308 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  39.03 
 
 
292 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  41.13 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  37.46 
 
 
297 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  37.1 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  34.68 
 
 
236 aa  117  3e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  26.73 
 
 
317 aa  108  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  28.38 
 
 
299 aa  101  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  33.74 
 
 
318 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  34.35 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  28.21 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  27.9 
 
 
224 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  27.66 
 
 
207 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  26.32 
 
 
239 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  24.88 
 
 
211 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  28.57 
 
 
222 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  26.04 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  25.84 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  25 
 
 
239 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  23.83 
 
 
205 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  23.46 
 
 
244 aa  49.3  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  29.73 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  27.78 
 
 
199 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  26.63 
 
 
212 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  23.67 
 
 
213 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  27.59 
 
 
208 aa  46.2  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  44.19 
 
 
213 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  27.88 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  24.42 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  27.98 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  26.5 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  38.89 
 
 
221 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  26.47 
 
 
215 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  28.12 
 
 
212 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  29.11 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  28.12 
 
 
212 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  30.63 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  30.1 
 
 
195 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  24.4 
 
 
212 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  37.04 
 
 
225 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>