More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0899 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  44.29 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  43.33 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  42.38 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  40.95 
 
 		 244 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  37 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  43.13 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  40.19 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  36.27 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  36.99 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  39.25 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  39.23 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  40 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  44.29 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  38.81 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  38.01 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  39.3 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  36.28 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  32.17 
 
 		 393 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  34.13 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  31.56 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  31.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  32.78 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  34.13 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  30.77 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  29.41 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  33.71 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  32.39 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  32.49 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  32.02 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  32.37 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  29.19 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  30.37 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  32.35 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  33.71 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  34.08 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  32.7 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  31.09 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  37.08 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  30.37 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  30.41 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  31.47 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  31.69 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  29.9 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  33.49 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  32.14 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  35 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  30.64 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  32.65 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  31.25 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  32 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  31.25 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  31.53 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  29.7 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  26.7 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  30.86 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  25.98 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  31.5 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  31.5 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  31.5 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  31.11 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  26.96 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  31.5 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  31.78 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  31.32 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  31.5 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  29.77 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  30.77 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  32 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  32.87 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  29.41 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  32 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  30.2 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  32.87 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  31.4 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  32.87 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  31.35 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  29.67 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  31.1 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  30.46 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  30.73 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  29.89 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  32.41 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  33.03 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  32.41 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  29.63 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>