More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0504 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  100 
 
 		 205 aa  423  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  54.33 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  50.49 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  49.04 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  45.19 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  41.38 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  40.89 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  39.02 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  38.54 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  38.05 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  35.61 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  43.66 
 
 		 234 aa  147  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  42.23 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 224 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  33.78 
 
 		 277 aa  141  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  40.36 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  38.7 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  37.14 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  36.95 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  40 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  34.67 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  35.2 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  33.69 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  37.04 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  34.95 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  33.82 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  35.12 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  30.45 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  30.92 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  30.69 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  34.47 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  32.67 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  32.67 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  34.19 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  33.97 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  28.8 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  29.86 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  32.04 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  35.98 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  31.6 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  31.87 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  30.15 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  29.47 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  31.19 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  30.65 
 
 		 257 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  34.46 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  34.3 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  29.91 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  35.93 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  34.3 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  33.95 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  30.49 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  31.03 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  31.03 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  31.84 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  28.5 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  29.03 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  31.88 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  29.03 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  29.06 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  33.13 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  29.44 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  32.68 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  31.55 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  32.35 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  32.2 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  29.44 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  31.44 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  31.82 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  33.81 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  29.01 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  29.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  30.91 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  32.51 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  31.53 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  32.5 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  31.64 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  31.36 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  26.83 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  31.68 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  33 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  30.77 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  31.36 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  31.52 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  29.31 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  31.6 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  30.61 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>