More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0780 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  72.58 
 
 		 198 aa  277  9e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  65.43 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  64.71 
 
 		 198 aa  263  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  40.82 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  36.36 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  38.58 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  34.8 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  34.16 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  35.61 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  37.1 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  34.16 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  33.66 
 
 		 239 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  37.31 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  36.6 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  37.24 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  29.78 
 
 		 277 aa  90.1  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  37.06 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  34.36 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  33.96 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  30.81 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  32.84 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  34.85 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  30 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  30.2 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  32.72 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  33.14 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  37.43 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  33.5 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  34.17 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  31.53 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  34.33 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  30.41 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  31.46 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  31 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  35.5 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  32.31 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  29 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  32.31 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  33.92 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  35.91 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  32.04 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  34.22 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  32.45 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  33.33 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  33.82 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  34.97 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  30.29 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  31.68 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  31.86 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  30.91 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  39.74 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  36.31 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  32.66 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  31.47 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  35.81 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  30.37 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  31.05 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  32.5 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  26.84 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  36.05 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  26.84 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  34.33 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  32.84 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  35.26 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  31.09 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  29.29 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  31.61 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  27.04 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  30.85 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  31.09 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  33.91 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  34.16 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  33.17 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  30.62 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  31.66 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  34.18 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  30.86 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  31.77 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  29.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  35.62 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  31.77 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  35 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  31.77 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  34.55 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  33.53 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>