50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0795 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  100 
 
 		 311 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  43.6 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  40.28 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  34.66 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  30.92 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  25.19 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  26.77 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  29.04 
 
 		 338 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  26.45 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  29.3 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  30.04 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  29.3 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  28.57 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  28.57 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  30.43 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  29.3 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  29.3 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  28.57 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  29.54 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  22.55 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  22.55 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  31.72 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  26.62 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  32.34 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  24.26 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  29.36 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  33.78 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  25.21 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  40.91 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  28.18 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  22.47 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  31.36 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  32.93 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  31.13 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  24.88 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  31.95 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  22.37 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  22.47 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  32.76 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  30.11 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  31.09 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  33.14 
 
 		 195 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  29.52 
 
 		 212 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  34.68 
 
 		 246 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  28.7 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  25.13 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  25.77 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  42.03 
 
 		 198 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0708  ribonuclease HII/HIII  26.6 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>