57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0708 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0708  ribonuclease HII/HIII  100 
 
 		 424 aa  842    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  26.58 
 
 		 209 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  24.16 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  28.04 
 
 		 205 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  28.81 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  25.44 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  27.49 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  28.78 
 
 		 221 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  26.67 
 
 		 244 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  22.46 
 
 		 292 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  25.29 
 
 		 215 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  24.12 
 
 		 277 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  27.06 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  26.29 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  27.81 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  25.88 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  26.5 
 
 		 245 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  25.93 
 
 		 239 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  25.86 
 
 		 212 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  26.01 
 
 		 209 aa  47  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  23.12 
 
 		 224 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  23.96 
 
 		 218 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  26.29 
 
 		 201 aa  46.6  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  25.6 
 
 		 199 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  27.33 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  25.86 
 
 		 212 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  27.33 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  23.58 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  21.51 
 
 		 198 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  23.67 
 
 		 220 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  24.44 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  24.86 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  23.95 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  23.18 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  23.86 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  25.88 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  23.46 
 
 		 197 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  24 
 
 		 200 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  20.61 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  23.98 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  24.57 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  25.51 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  26.16 
 
 		 257 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  23.6 
 
 		 213 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  25.12 
 
 		 196 aa  43.9  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  26.29 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  23.11 
 
 		 213 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  22.75 
 
 		 208 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  25.88 
 
 		 210 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  24.28 
 
 		 255 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  24.28 
 
 		 255 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  22.62 
 
 		 207 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  22.71 
 
 		 303 aa  43.1  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  22.58 
 
 		 206 aa  43.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  26.44 
 
 		 212 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  26.6 
 
 		 311 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  25.29 
 
 		 190 aa  43.1  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>