44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2587 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  55.67 
 
 		 296 aa  292  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  52.94 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  38.64 
 
 		 337 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  38.96 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  38.89 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  38.64 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  39.03 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  38.64 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  38.31 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  38.44 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  38.44 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  37.99 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  39.48 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  39.48 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  37.79 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  36.63 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  41.42 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  35.95 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  32.18 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  36.42 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  41.98 
 
 		 142 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  31.08 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  30.09 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  30.11 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  26.76 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  25.29 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  25.72 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  27.44 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0708  ribonuclease HII/HIII  22.46 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  31.94 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  25.45 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  24.46 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  32.5 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  28.44 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  26.35 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  29.17 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  26.83 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  22.67 
 
 		 393 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  23.89 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  26.26 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  23.03 
 
 		 195 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>