49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1722 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  100 
 
 		 297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  63.97 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  52.94 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  37.82 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  37.82 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  37.82 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  37.82 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  40.99 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  37.5 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  37.46 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  37.5 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  37.18 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  37.82 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  37.5 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  35.48 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  38.56 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  37.28 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  37.28 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  36.36 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  33.33 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  31.53 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  35.26 
 
 		 177 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  41.35 
 
 		 142 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  28.62 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  29.58 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  27.07 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  24.27 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  29.21 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  27.83 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  28.08 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  28.43 
 
 		 213 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  28.48 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  28.21 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  26.96 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  23.08 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  24.3 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  23.67 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  25.96 
 
 		 224 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  25.77 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  23.12 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0708  ribonuclease HII/HIII  23.95 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  22.05 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  28.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  32.11 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  28.71 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  25 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  28.28 
 
 		 205 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  28.33 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  24 
 
 		 215 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>