53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf243 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  34.82 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  34.68 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  34.23 
 
 		 311 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  34.23 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  34.23 
 
 		 311 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  34.23 
 
 		 337 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  34.23 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  34.23 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  33.78 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  33.33 
 
 		 311 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  31.7 
 
 		 308 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  34.27 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  34.27 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  31.53 
 
 		 297 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  26.36 
 
 		 311 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  30.13 
 
 		 299 aa  92.4  6e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  31.08 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  31.34 
 
 		 296 aa  89.7  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  29.39 
 
 		 317 aa  89.4  5e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  27.73 
 
 		 303 aa  85.1  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  27.07 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  28.64 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  26.94 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  41.25 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  31.69 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  23.81 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  25.22 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  27.03 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  25.65 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  24.89 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  28.72 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  28.86 
 
 		 347 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  26.11 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  27.65 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  27.91 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  26.37 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0946  ribonuclease HII  25.12 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  27.6 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  24.45 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  24.45 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  26.38 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  23.73 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  27.44 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  26.19 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  24.76 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  21.46 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  25.84 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  33.96 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  26.7 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  25.81 
 
 		 256 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  24.87 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  22.83 
 
 		 227 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>