More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0946 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0946  ribonuclease HII  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  83.25 
 
 		 209 aa  367  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  56.5 
 
 		 198 aa  223  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 198 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 198 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 198 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  45.54 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  51.11 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  47.29 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.72 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  48 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  48 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  48.69 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  44.95 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  45.54 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  46.67 
 
 		 227 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  44.22 
 
 		 210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 248 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  45.95 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  45.77 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  46.93 
 
 		 198 aa  161  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  45.79 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  43.84 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.92 
 
 		 268 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  46.63 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 214 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  42.21 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  45.03 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  47.25 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  42.16 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  45 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  43.84 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  43.09 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  41.21 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 217 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  44 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.56 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>