More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1120 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 480 aa  951    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  36.33 
 
 		 698 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  35.96 
 
 		 630 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  36.48 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  36.05 
 
 		 653 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  36.59 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  37.98 
 
 		 601 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  40.64 
 
 		 611 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  38.2 
 
 		 629 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  35.19 
 
 		 660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.65 
 
 		 682 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  38.52 
 
 		 622 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  34.6 
 
 		 639 aa  208  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  38.12 
 
 		 612 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.38 
 
 		 720 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  37.89 
 
 		 605 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  36.17 
 
 		 621 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  38.05 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  37.29 
 
 		 621 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  37.3 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  37.16 
 
 		 593 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  35.31 
 
 		 640 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  34.24 
 
 		 633 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  31.8 
 
 		 684 aa  196  9e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.84 
 
 		 723 aa  196  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.1 
 
 		 681 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  34.69 
 
 		 629 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  37.18 
 
 		 624 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  36.04 
 
 		 623 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  33.2 
 
 		 644 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.14 
 
 		 713 aa  183  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.28 
 
 		 727 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  35.04 
 
 		 623 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  34.8 
 
 		 623 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  35.31 
 
 		 615 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  35.31 
 
 		 615 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  37.53 
 
 		 621 aa  171  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  34.09 
 
 		 479 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  35.07 
 
 		 615 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  34.18 
 
 		 610 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  35.89 
 
 		 623 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  27.19 
 
 		 715 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  41.08 
 
 		 626 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  33.85 
 
 		 718 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  33.87 
 
 		 720 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 720 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  34.17 
 
 		 721 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  33.08 
 
 		 723 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  34.54 
 
 		 738 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  32.57 
 
 		 720 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  34.17 
 
 		 716 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  35.9 
 
 		 620 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  33.06 
 
 		 719 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  27.55 
 
 		 709 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  34.38 
 
 		 720 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  25.8 
 
 		 739 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 719 aa  153  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  33.73 
 
 		 731 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  27.53 
 
 		 714 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  27.49 
 
 		 618 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  26.24 
 
 		 724 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  27.68 
 
 		 712 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  33.75 
 
 		 722 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  34.29 
 
 		 716 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  25.74 
 
 		 714 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.08 
 
 		 706 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  33.73 
 
 		 714 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  28.14 
 
 		 709 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  28.14 
 
 		 709 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  34 
 
 		 661 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  27.98 
 
 		 709 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  28.27 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  27.87 
 
 		 717 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  32.58 
 
 		 652 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  27.94 
 
 		 722 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5086  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  26.05 
 
 		 545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0229  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.79 
 
 		 553 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 718 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  27.37 
 
 		 712 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  32.99 
 
 		 597 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  26.88 
 
 		 712 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  26.85 
 
 		 1081 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  26.85 
 
 		 714 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  33.75 
 
 		 712 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  32.81 
 
 		 715 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  37.18 
 
 		 600 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  26.43 
 
 		 714 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  26.41 
 
 		 718 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  26.2 
 
 		 718 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6641  Methylmalonyl-CoA mutase  32.96 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.16 
 
 		 738 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  32.92 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  24.25 
 
 		 706 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  34.17 
 
 		 712 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1622  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  26.42 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 754 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0726  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.83 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 725 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  29.6 
 
 		 604 aa  133  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  31.6 
 
 		 711 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>