More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1921 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  61.68 
 
 		 633 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 601 aa  1171    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  63.09 
 
 		 614 aa  670    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  57.45 
 
 		 593 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  55.37 
 
 		 660 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  55.57 
 
 		 653 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  54.91 
 
 		 640 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  53.99 
 
 		 630 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  52.04 
 
 		 622 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  51.55 
 
 		 644 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  41.46 
 
 		 698 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  46.58 
 
 		 612 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  42.52 
 
 		 621 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  46.5 
 
 		 611 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  41.51 
 
 		 623 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.3 
 
 		 615 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  44.8 
 
 		 623 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  44.44 
 
 		 615 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  44.44 
 
 		 615 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  48.12 
 
 		 569 aa  331  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  42.44 
 
 		 629 aa  329  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  42.06 
 
 		 629 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.5 
 
 		 620 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.99 
 
 		 626 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  43.56 
 
 		 605 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  43.82 
 
 		 605 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  43.99 
 
 		 605 aa  319  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  42.21 
 
 		 623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  39.55 
 
 		 639 aa  301  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  40.26 
 
 		 621 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  41.06 
 
 		 652 aa  300  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  41.14 
 
 		 623 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  46.83 
 
 		 600 aa  289  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.97 
 
 		 681 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  39.55 
 
 		 610 aa  277  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.17 
 
 		 682 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.41 
 
 		 720 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  39.57 
 
 		 597 aa  270  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  37.6 
 
 		 624 aa  264  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  32.43 
 
 		 684 aa  263  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.63 
 
 		 723 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  38.58 
 
 		 621 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  34.88 
 
 		 710 aa  253  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.21 
 
 		 713 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.16 
 
 		 618 aa  221  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.78 
 
 		 706 aa  216  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  38.12 
 
 		 480 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  37.36 
 
 		 489 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.15 
 
 		 727 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  33.77 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  29.11 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  30.23 
 
 		 712 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  30.21 
 
 		 714 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  30.36 
 
 		 714 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  38.19 
 
 		 720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  29 
 
 		 709 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  29.13 
 
 		 709 aa  165  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  36.59 
 
 		 661 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3042  methylmalonyl-CoA mutase  38.19 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  28.78 
 
 		 709 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  35.04 
 
 		 716 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  29.09 
 
 		 709 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  38.58 
 
 		 718 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  38.21 
 
 		 718 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  29.72 
 
 		 712 aa  160  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  39.36 
 
 		 738 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  30 
 
 		 591 aa  160  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  37.4 
 
 		 736 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  34.92 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  28.87 
 
 		 712 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  35.8 
 
 		 733 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  28.69 
 
 		 712 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  34.96 
 
 		 722 aa  158  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  28.27 
 
 		 712 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  37.4 
 
 		 719 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  35.71 
 
 		 715 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  36.86 
 
 		 719 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  39.11 
 
 		 725 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  30.2 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  28.66 
 
 		 712 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  36.22 
 
 		 720 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  34.87 
 
 		 714 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  34.8 
 
 		 718 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  34.75 
 
 		 731 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1736  methylmalonyl-CoA mutase  35.63 
 
 		 721 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  35.02 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  35 
 
 		 721 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  35.77 
 
 		 722 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.91 
 
 		 736 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  28.35 
 
 		 720 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  28.35 
 
 		 720 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  38.21 
 
 		 740 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  34.14 
 
 		 718 aa  153  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  38.24 
 
 		 754 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  34.63 
 
 		 740 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.2 
 
 		 724 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  36.61 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  35.43 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0856  methylmalonyl-CoA mutase  37.2 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4794  methylmalonyl-CoA mutase  36.33 
 
 		 721 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134601  normal  0.670991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>