More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3650 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  100 
 
 		 620 aa  1219    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  70.56 
 
 		 615 aa  788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  65.61 
 
 		 623 aa  716    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  70.56 
 
 		 615 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  79.01 
 
 		 626 aa  903    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  70.39 
 
 		 615 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  48.82 
 
 		 652 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  45.57 
 
 		 597 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  45.69 
 
 		 614 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  45.16 
 
 		 630 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  43.49 
 
 		 593 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  43.66 
 
 		 644 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  43.26 
 
 		 660 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  41.49 
 
 		 633 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  42.48 
 
 		 653 aa  363  6e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  45.58 
 
 		 622 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  43.01 
 
 		 640 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  41.84 
 
 		 601 aa  329  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  36.16 
 
 		 698 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  37.33 
 
 		 621 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  38.59 
 
 		 612 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  37.26 
 
 		 629 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  39.8 
 
 		 611 aa  267  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  38.17 
 
 		 629 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  38.82 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  37.02 
 
 		 623 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  35.99 
 
 		 621 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  35.79 
 
 		 639 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  39.18 
 
 		 605 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  36.66 
 
 		 623 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  38.36 
 
 		 605 aa  233  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  39.61 
 
 		 569 aa  232  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  40.45 
 
 		 600 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  33.58 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.73 
 
 		 682 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.15 
 
 		 681 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  35.06 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.59 
 
 		 713 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  37.13 
 
 		 621 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.51 
 
 		 618 aa  211  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.38 
 
 		 723 aa  207  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.24 
 
 		 720 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  31.28 
 
 		 684 aa  193  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.09 
 
 		 706 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  35.27 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  31.05 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  33.56 
 
 		 610 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.79 
 
 		 727 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  30.09 
 
 		 740 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  33.69 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  29.21 
 
 		 709 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  30.43 
 
 		 714 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  29.48 
 
 		 722 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  29.03 
 
 		 709 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  28.24 
 
 		 589 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  29.01 
 
 		 709 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  28.54 
 
 		 721 aa  153  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  29.33 
 
 		 714 aa  153  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  28.51 
 
 		 716 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  29.83 
 
 		 712 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  29.8 
 
 		 740 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  30.98 
 
 		 724 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  29.65 
 
 		 733 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  29.18 
 
 		 712 aa  151  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  28.55 
 
 		 725 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  38.26 
 
 		 1106 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  28.92 
 
 		 731 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  28.92 
 
 		 714 aa  150  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  25.95 
 
 		 591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  28.38 
 
 		 723 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  35.9 
 
 		 480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  30 
 
 		 740 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  28.49 
 
 		 718 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  29.02 
 
 		 706 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  29.98 
 
 		 722 aa  148  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  28.94 
 
 		 712 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  28.11 
 
 		 588 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.65 
 
 		 719 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  29.71 
 
 		 718 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  28.14 
 
 		 714 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  28.44 
 
 		 720 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  29.6 
 
 		 712 aa  147  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  28.44 
 
 		 720 aa  146  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  29.42 
 
 		 754 aa  146  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  34.73 
 
 		 716 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2762  methylmalonyl-CoA mutase  29.2 
 
 		 740 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  28.03 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.99 
 
 		 736 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.96 
 
 		 724 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  29.87 
 
 		 754 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  33.97 
 
 		 718 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  28.19 
 
 		 731 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.75 
 
 		 738 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  28.48 
 
 		 738 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  27.71 
 
 		 720 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  28.54 
 
 		 720 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  28.25 
 
 		 719 aa  144  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  28.82 
 
 		 718 aa  144  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  27.46 
 
 		 731 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  38.37 
 
 		 720 aa  143  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>