More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1943 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  71.56 
 
 		 660 aa  826    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 653 aa  1264    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  61.57 
 
 		 614 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  56.13 
 
 		 630 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  53.64 
 
 		 633 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  53.38 
 
 		 640 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  55.47 
 
 		 622 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  54.14 
 
 		 593 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  55.81 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  50.39 
 
 		 644 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  44.48 
 
 		 698 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  42.19 
 
 		 621 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  40.97 
 
 		 623 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  45.79 
 
 		 626 aa  364  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  42.41 
 
 		 615 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  41.19 
 
 		 612 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  42.26 
 
 		 615 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  42.26 
 
 		 615 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  42.88 
 
 		 623 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  42.19 
 
 		 629 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.1 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  41.69 
 
 		 623 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  41.82 
 
 		 629 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.98 
 
 		 681 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  40.36 
 
 		 621 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  42.06 
 
 		 611 aa  332  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.62 
 
 		 720 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  40.18 
 
 		 623 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  42.39 
 
 		 605 aa  326  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  41.77 
 
 		 605 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  41.93 
 
 		 605 aa  317  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  38.96 
 
 		 639 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.37 
 
 		 682 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  40.4 
 
 		 652 aa  303  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.59 
 
 		 723 aa  299  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  30.88 
 
 		 684 aa  291  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  38.69 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.51 
 
 		 713 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  38.15 
 
 		 597 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  42.16 
 
 		 569 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  36.28 
 
 		 624 aa  278  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  43.15 
 
 		 600 aa  273  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.67 
 
 		 727 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.63 
 
 		 618 aa  264  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  37.04 
 
 		 710 aa  259  8e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  36.64 
 
 		 621 aa  259  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.87 
 
 		 706 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  38.28 
 
 		 489 aa  220  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  32.96 
 
 		 716 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  36.27 
 
 		 480 aa  207  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  31.55 
 
 		 709 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  31.33 
 
 		 709 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  31.25 
 
 		 709 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  31.34 
 
 		 714 aa  200  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  31.49 
 
 		 712 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  33.72 
 
 		 712 aa  196  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  32.35 
 
 		 731 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  32.02 
 
 		 722 aa  195  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  32.11 
 
 		 714 aa  194  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  31.37 
 
 		 718 aa  193  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  30.63 
 
 		 738 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  31.88 
 
 		 714 aa  193  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  31.88 
 
 		 714 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.88 
 
 		 714 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  31.88 
 
 		 714 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  31.88 
 
 		 714 aa  193  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  31.88 
 
 		 714 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  30.09 
 
 		 719 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  31.79 
 
 		 719 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  31.65 
 
 		 714 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  31.89 
 
 		 715 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  31.03 
 
 		 714 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  32.65 
 
 		 712 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  31.21 
 
 		 712 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  30.86 
 
 		 721 aa  190  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  30.32 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  30.86 
 
 		 714 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  31.7 
 
 		 712 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  31.69 
 
 		 733 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  29.41 
 
 		 720 aa  188  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  30.52 
 
 		 712 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  29.79 
 
 		 720 aa  187  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  31.86 
 
 		 722 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  31.34 
 
 		 717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  31.93 
 
 		 714 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  30.57 
 
 		 709 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  36.32 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  29.8 
 
 		 716 aa  184  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  33.18 
 
 		 740 aa  184  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.35 
 
 		 738 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  27.06 
 
 		 604 aa  183  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  32.06 
 
 		 754 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  30.56 
 
 		 718 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  30.93 
 
 		 740 aa  180  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  29.7 
 
 		 720 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.72 
 
 		 713 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  30.7 
 
 		 740 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  32.43 
 
 		 725 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  28.72 
 
 		 724 aa  179  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  29.7 
 
 		 720 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>