More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2345 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  70.51 
 
 		 629 aa  755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  88.93 
 
 		 605 aa  966    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  64.64 
 
 		 612 aa  685    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  88.76 
 
 		 605 aa  959    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  63.3 
 
 		 611 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 605 aa  1176    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  53.82 
 
 		 621 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  52.44 
 
 		 623 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  52.82 
 
 		 621 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  53.03 
 
 		 623 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  51.55 
 
 		 639 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  52.66 
 
 		 629 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  51.36 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  47.19 
 
 		 624 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  48.92 
 
 		 610 aa  435  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  43.87 
 
 		 698 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  46.21 
 
 		 621 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  43.59 
 
 		 630 aa  392  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  42.33 
 
 		 614 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  45.16 
 
 		 622 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  44.12 
 
 		 601 aa  352  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  41.61 
 
 		 653 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  43.21 
 
 		 660 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  43.68 
 
 		 593 aa  341  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  42.49 
 
 		 644 aa  332  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  39.1 
 
 		 640 aa  324  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  39.76 
 
 		 633 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.62 
 
 		 720 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  41.51 
 
 		 479 aa  296  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  32.37 
 
 		 684 aa  287  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.38 
 
 		 681 aa  283  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.43 
 
 		 713 aa  279  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  36.55 
 
 		 615 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  36.39 
 
 		 615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  36.39 
 
 		 615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  38.55 
 
 		 623 aa  262  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.33 
 
 		 682 aa  262  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  37.74 
 
 		 626 aa  257  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  38.36 
 
 		 620 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.4 
 
 		 723 aa  243  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.97 
 
 		 706 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  37.72 
 
 		 652 aa  241  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.57 
 
 		 618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  39.24 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.1 
 
 		 727 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  35.14 
 
 		 597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  38.5 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  39.09 
 
 		 600 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  37.8 
 
 		 569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  31.72 
 
 		 710 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  28.73 
 
 		 604 aa  192  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  27.71 
 
 		 591 aa  186  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1222  methylmalonyl-CoA mutase N-terminal domain-containing protein  29.03 
 
 		 597 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  27.96 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  28.63 
 
 		 709 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  29.05 
 
 		 715 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  28.38 
 
 		 588 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07140  methylmalonyl-COA mutase small subunit  27.66 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  27.86 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  27.87 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  28.24 
 
 		 589 aa  151  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  28.84 
 
 		 709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  28.84 
 
 		 709 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  27.67 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  36.93 
 
 		 661 aa  148  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  29.4 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  28.93 
 
 		 709 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  29.52 
 
 		 712 aa  146  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  27.52 
 
 		 712 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  33.6 
 
 		 721 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  33.68 
 
 		 707 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0013  methylmalonyl-CoA mutase  25.52 
 
 		 453 aa  144  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 716 aa  143  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  27.79 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  31.74 
 
 		 711 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  26.96 
 
 		 731 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  36.36 
 
 		 712 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  27.52 
 
 		 718 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  34.95 
 
 		 712 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  36.21 
 
 		 712 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1983  methylmalonyl-CoA mutase  28.61 
 
 		 714 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.774356  normal  0.0211504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1622  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.27 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 722 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  27.33 
 
 		 714 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  27.33 
 
 		 714 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  27.33 
 
 		 714 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.33 
 
 		 714 aa  137  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  27.33 
 
 		 714 aa  137  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  27.33 
 
 		 714 aa  137  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  26.62 
 
 		 713 aa  136  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  27.74 
 
 		 715 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2762  methylmalonyl-CoA mutase  29.41 
 
 		 740 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  34.3 
 
 		 720 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  28.38 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  28.99 
 
 		 723 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  27.33 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.28 
 
 		 1106 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  32.78 
 
 		 731 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  26.79 
 
 		 724 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  34.3 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>