More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3184 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  70.05 
 
 		 623 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  100 
 
 		 615 aa  1208    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  100 
 
 		 615 aa  1208    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  71.57 
 
 		 626 aa  806    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  99.02 
 
 		 615 aa  1198    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  70.56 
 
 		 620 aa  779    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  50.08 
 
 		 652 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  44.95 
 
 		 597 aa  402  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  47.24 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  43.78 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  43.72 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  43.16 
 
 		 660 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  43.63 
 
 		 644 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  40.06 
 
 		 633 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  46.17 
 
 		 622 aa  351  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  43.13 
 
 		 640 aa  349  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  41.95 
 
 		 653 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  44.44 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  37.03 
 
 		 698 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  38.34 
 
 		 612 aa  277  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  37.81 
 
 		 629 aa  277  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  35.84 
 
 		 623 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  39.22 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.13 
 
 		 681 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  34.63 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  35.69 
 
 		 623 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  35.34 
 
 		 639 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  37.36 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.44 
 
 		 682 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  35.75 
 
 		 621 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  37.04 
 
 		 605 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  36.12 
 
 		 605 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  37.24 
 
 		 629 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  34.67 
 
 		 623 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  34.51 
 
 		 710 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  38.75 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  41.44 
 
 		 600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.44 
 
 		 713 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.7 
 
 		 723 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  29.86 
 
 		 618 aa  202  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  31.93 
 
 		 684 aa  201  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.52 
 
 		 720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  34.4 
 
 		 621 aa  193  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.92 
 
 		 706 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  34.4 
 
 		 610 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  32.36 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  36.19 
 
 		 489 aa  170  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.5 
 
 		 727 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  31.61 
 
 		 714 aa  167  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  35.7 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  31.63 
 
 		 738 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  30.62 
 
 		 718 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  30.09 
 
 		 714 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  29.23 
 
 		 706 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.75 
 
 		 736 aa  161  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  30.49 
 
 		 714 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  30.39 
 
 		 716 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  29.05 
 
 		 714 aa  160  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  30.54 
 
 		 714 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  30.56 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  30.54 
 
 		 714 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  30.54 
 
 		 714 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  30.54 
 
 		 714 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  30.79 
 
 		 722 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  30.49 
 
 		 714 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.54 
 
 		 714 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32 
 
 		 738 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  30.71 
 
 		 731 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  30.94 
 
 		 715 aa  158  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  30.34 
 
 		 731 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  31.22 
 
 		 712 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.63 
 
 		 1106 aa  157  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  30.56 
 
 		 720 aa  157  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  30.47 
 
 		 714 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.36 
 
 		 724 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  30.34 
 
 		 719 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  31.5 
 
 		 722 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  30.68 
 
 		 718 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  30.56 
 
 		 720 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  31.72 
 
 		 725 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  30.02 
 
 		 723 aa  154  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  32.01 
 
 		 740 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  28.78 
 
 		 731 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  30.23 
 
 		 740 aa  153  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  30.68 
 
 		 716 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  30.43 
 
 		 720 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  29.53 
 
 		 712 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  30.45 
 
 		 733 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  30.13 
 
 		 721 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  31.21 
 
 		 754 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  31.29 
 
 		 712 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  30.92 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  40.66 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  30.29 
 
 		 709 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  30.29 
 
 		 709 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  30.6 
 
 		 709 aa  151  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  30.28 
 
 		 720 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  30 
 
 		 740 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2762  methylmalonyl-CoA mutase  30.48 
 
 		 740 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  30.18 
 
 		 718 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>