More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3871 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  82.43 
 
 		 723 aa  1208    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  67.13 
 
 		 713 aa  950    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.86 
 
 		 727 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  100 
 
 		 720 aa  1466    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.55 
 
 		 681 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  42.23 
 
 		 684 aa  534  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.03 
 
 		 706 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.27 
 
 		 682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  40.83 
 
 		 698 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  35 
 
 		 716 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  34.94 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  35.04 
 
 		 706 aa  376  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  32.83 
 
 		 712 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  34.33 
 
 		 712 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  35.59 
 
 		 740 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  34.58 
 
 		 722 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.92 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  35.92 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  35.45 
 
 		 718 aa  363  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  33.38 
 
 		 720 aa  363  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  33.89 
 
 		 709 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  35.62 
 
 		 714 aa  363  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  32.29 
 
 		 714 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  34.19 
 
 		 712 aa  361  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  34.6 
 
 		 715 aa  361  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  33.73 
 
 		 709 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  33.68 
 
 		 731 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  33.84 
 
 		 718 aa  360  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  35.12 
 
 		 712 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  34.77 
 
 		 740 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  34.04 
 
 		 717 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 724 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  33.86 
 
 		 714 aa  356  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  33.43 
 
 		 720 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  34.61 
 
 		 722 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  32.49 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  34.26 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  34.67 
 
 		 725 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  33.28 
 
 		 720 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  33.97 
 
 		 709 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 719 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  34.65 
 
 		 754 aa  352  8.999999999999999e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  34.95 
 
 		 720 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05680  methylmalonyl-CoA mutase  35.6 
 
 		 726 aa  351  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  33.98 
 
 		 709 aa  350  6e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  31.4 
 
 		 716 aa  349  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  32.75 
 
 		 739 aa  348  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  34.07 
 
 		 733 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.61 
 
 		 713 aa  347  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  32.32 
 
 		 715 aa  345  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  33.23 
 
 		 723 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  32.83 
 
 		 738 aa  343  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  32.49 
 
 		 720 aa  343  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  34.33 
 
 		 712 aa  343  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  33.28 
 
 		 712 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  32.33 
 
 		 719 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3042  methylmalonyl-CoA mutase  34.55 
 
 		 720 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  32.43 
 
 		 731 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  32.66 
 
 		 707 aa  337  5.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  34.05 
 
 		 729 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.15 
 
 		 736 aa  334  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  32.19 
 
 		 711 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  32.73 
 
 		 721 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  33.59 
 
 		 718 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.03 
 
 		 1081 aa  330  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.49 
 
 		 724 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  32.79 
 
 		 732 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2762  methylmalonyl-CoA mutase  34.06 
 
 		 740 aa  327  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  33.9 
 
 		 718 aa  327  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.73 
 
 		 1106 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  35.11 
 
 		 740 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.44 
 
 		 719 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  33.28 
 
 		 719 aa  325  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  34.4 
 
 		 720 aa  324  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  32.04 
 
 		 712 aa  324  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  35.12 
 
 		 754 aa  323  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  33.28 
 
 		 712 aa  323  9.000000000000001e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  32.19 
 
 		 715 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  32.41 
 
 		 723 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  33.44 
 
 		 736 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.18 
 
 		 735 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  34.35 
 
 		 661 aa  320  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  32.42 
 
 		 972 aa  320  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2238  methylmalonyl-CoA mutase  32.94 
 
 		 722 aa  320  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  33.44 
 
 		 719 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1983  methylmalonyl-CoA mutase  32.29 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.774356  normal  0.0211504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5337  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 721 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.759699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2420  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.79 
 
 		 763 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4731  methylmalonyl-CoA mutase  33.59 
 
 		 718 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4794  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 721 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134601  normal  0.670991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5261  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 721 aa  310  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  32.27 
 
 		 720 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1736  methylmalonyl-CoA mutase  32.35 
 
 		 721 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2199  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.98 
 
 		 727 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.94 
 
 		 738 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>