More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1165 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 589 aa  1219    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  48.56 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  48.63 
 
 		 604 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  48.05 
 
 		 588 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1222  methylmalonyl-CoA mutase N-terminal domain-containing protein  41.82 
 
 		 597 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  29.07 
 
 		 618 aa  237  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6641  Methylmalonyl-CoA mutase  32.77 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.51 
 
 		 1106 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  24.5 
 
 		 720 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.61 
 
 		 1081 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  23.82 
 
 		 681 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.19 
 
 		 713 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.14 
 
 		 723 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  29.1 
 
 		 684 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  26.28 
 
 		 644 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  31.3 
 
 		 621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  26.45 
 
 		 640 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  24.48 
 
 		 682 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0013  methylmalonyl-CoA mutase  27.59 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  24.71 
 
 		 698 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  26.45 
 
 		 623 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  25.93 
 
 		 712 aa  161  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  25.37 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  32.28 
 
 		 712 aa  158  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  26.56 
 
 		 623 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  25.95 
 
 		 614 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.63 
 
 		 706 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  26.23 
 
 		 639 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  32.28 
 
 		 714 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  32.96 
 
 		 712 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  26.49 
 
 		 629 aa  153  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  25.49 
 
 		 621 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  28.13 
 
 		 612 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 718 aa  150  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  33.05 
 
 		 661 aa  150  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  24.43 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  32.31 
 
 		 731 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  33.05 
 
 		 712 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  29.25 
 
 		 629 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  32.58 
 
 		 712 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  32.64 
 
 		 709 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  32.64 
 
 		 709 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  28.99 
 
 		 623 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  32.64 
 
 		 714 aa  146  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  30.96 
 
 		 716 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07140  methylmalonyl-COA mutase small subunit  24.47 
 
 		 448 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  25.97 
 
 		 593 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  32.22 
 
 		 709 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  26.97 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  31.8 
 
 		 972 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  24.83 
 
 		 718 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  32.64 
 
 		 712 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.75 
 
 		 724 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  31.38 
 
 		 717 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  30.74 
 
 		 719 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  24.52 
 
 		 723 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  24.67 
 
 		 714 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  28.43 
 
 		 611 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  31.27 
 
 		 633 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  29.32 
 
 		 660 aa  144  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  30.96 
 
 		 716 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  27.62 
 
 		 615 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  30.96 
 
 		 738 aa  143  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  31.38 
 
 		 722 aa  143  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  29.73 
 
 		 620 aa  143  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  24.07 
 
 		 714 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  24.43 
 
 		 720 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  25.12 
 
 		 719 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  32.64 
 
 		 722 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  24.43 
 
 		 720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  27.44 
 
 		 615 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  27.44 
 
 		 615 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.8 
 
 		 713 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  31.8 
 
 		 709 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  30.13 
 
 		 720 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  32.23 
 
 		 715 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  25.92 
 
 		 605 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  30.6 
 
 		 622 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  30.96 
 
 		 707 aa  139  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.43 
 
 		 738 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  31.8 
 
 		 731 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  30.13 
 
 		 715 aa  138  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  29.71 
 
 		 721 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 733 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  31.65 
 
 		 740 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  32.22 
 
 		 718 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  28.34 
 
 		 489 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  31.38 
 
 		 712 aa  137  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  29.46 
 
 		 714 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  29.46 
 
 		 714 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  26.18 
 
 		 724 aa  136  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  29.46 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  29.46 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  31.8 
 
 		 731 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  29.46 
 
 		 714 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  29.46 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.46 
 
 		 714 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  29.07 
 
 		 714 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  27.61 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>