More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6641 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6641  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 448 aa  917    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  31.04 
 
 		 591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  32.3 
 
 		 604 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  32.77 
 
 		 589 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1222  methylmalonyl-CoA mutase N-terminal domain-containing protein  32.85 
 
 		 597 aa  192  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  29.71 
 
 		 618 aa  190  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.04 
 
 		 682 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  32.17 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.59 
 
 		 720 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.37 
 
 		 681 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0013  methylmalonyl-CoA mutase  28.33 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  29.49 
 
 		 714 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.78 
 
 		 723 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  29.34 
 
 		 712 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.42 
 
 		 713 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  37.34 
 
 		 714 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  29.34 
 
 		 640 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.33 
 
 		 706 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  30.77 
 
 		 684 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  38.59 
 
 		 718 aa  156  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  35.95 
 
 		 714 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  27.8 
 
 		 712 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  35.54 
 
 		 716 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  36.07 
 
 		 715 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  35.29 
 
 		 698 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.84 
 
 		 724 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07140  methylmalonyl-COA mutase small subunit  28.3 
 
 		 448 aa  153  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  34.84 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  34.84 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  34.84 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  34.84 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.84 
 
 		 714 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  34.22 
 
 		 661 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  34.84 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  34.43 
 
 		 714 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  34.84 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  27.87 
 
 		 712 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  35.4 
 
 		 630 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  35.11 
 
 		 712 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  29.95 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  35.8 
 
 		 722 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  34.98 
 
 		 709 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.18 
 
 		 727 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  35.54 
 
 		 718 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  27.42 
 
 		 715 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  26.11 
 
 		 712 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.34 
 
 		 1106 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  27.13 
 
 		 722 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  34.3 
 
 		 738 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  32.96 
 
 		 723 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  34.35 
 
 		 717 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.12 
 
 		 713 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05680  methylmalonyl-CoA mutase  29 
 
 		 726 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  34.02 
 
 		 711 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 716 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  32.57 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  34.01 
 
 		 733 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  27.17 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  30.16 
 
 		 614 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 720 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  34.71 
 
 		 740 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  35.8 
 
 		 712 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  34.3 
 
 		 720 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 709 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 721 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  27.14 
 
 		 714 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  32.95 
 
 		 709 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  32.95 
 
 		 709 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  33.88 
 
 		 740 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  36.21 
 
 		 740 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  33.88 
 
 		 720 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  27.9 
 
 		 660 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  33.88 
 
 		 720 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  33.61 
 
 		 972 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  28.83 
 
 		 725 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  32.36 
 
 		 644 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  34.02 
 
 		 731 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  35.8 
 
 		 754 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  31.31 
 
 		 479 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  31.71 
 
 		 706 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  34.58 
 
 		 713 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5166  methylmalonyl-CoA mutase  34.43 
 
 		 724 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  33.2 
 
 		 707 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1983  methylmalonyl-CoA mutase  33.61 
 
 		 714 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.774356  normal  0.0211504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  34.98 
 
 		 720 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  34.16 
 
 		 712 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51830  methylmalonyl-coa mutase  34.52 
 
 		 719 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  37.18 
 
 		 621 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  31.15 
 
 		 731 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1736  methylmalonyl-CoA mutase  35.25 
 
 		 721 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.98 
 
 		 738 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  33.2 
 
 		 723 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  35.63 
 
 		 732 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  31.36 
 
 		 601 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  38.41 
 
 		 629 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  34.71 
 
 		 724 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.98 
 
 		 735 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  27.7 
 
 		 720 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.33 
 
 		 1081 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  34.44 
 
 		 720 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>