More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0857 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 479 aa  964    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  45.2 
 
 		 629 aa  333  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  43.04 
 
 		 621 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  45.82 
 
 		 623 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  44.68 
 
 		 639 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  44.79 
 
 		 623 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  45.66 
 
 		 612 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  44 
 
 		 621 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  42.67 
 
 		 623 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  43.47 
 
 		 629 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  44.8 
 
 		 611 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  42.21 
 
 		 621 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  40.39 
 
 		 605 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  40.36 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  41.51 
 
 		 605 aa  279  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  42.17 
 
 		 624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  40.18 
 
 		 610 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  34.48 
 
 		 698 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  36.42 
 
 		 489 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  36.38 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  35.49 
 
 		 660 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  35.82 
 
 		 644 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.44 
 
 		 681 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  37 
 
 		 622 aa  203  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  34.42 
 
 		 593 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  33.4 
 
 		 630 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  35.08 
 
 		 653 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  34.98 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.82 
 
 		 682 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  31 
 
 		 684 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  35.71 
 
 		 640 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 633 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.91 
 
 		 723 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  33.85 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.72 
 
 		 713 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  40.25 
 
 		 615 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  40.25 
 
 		 615 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  40.25 
 
 		 615 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  32.55 
 
 		 710 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6641  Methylmalonyl-CoA mutase  31.31 
 
 		 448 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  34.29 
 
 		 652 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  30.36 
 
 		 588 aa  149  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  40.47 
 
 		 597 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  28.05 
 
 		 618 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  33.69 
 
 		 620 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  36.67 
 
 		 714 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.85 
 
 		 727 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  42.04 
 
 		 626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  26.72 
 
 		 718 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  27.33 
 
 		 714 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1222  methylmalonyl-CoA mutase N-terminal domain-containing protein  30.28 
 
 		 597 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  35.59 
 
 		 623 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  27.12 
 
 		 714 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  28.33 
 
 		 736 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  27.23 
 
 		 714 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  27.23 
 
 		 714 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  27.23 
 
 		 714 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  26.74 
 
 		 714 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  27.23 
 
 		 714 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  27.02 
 
 		 714 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.23 
 
 		 714 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  47.24 
 
 		 600 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  33.6 
 
 		 707 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07140  methylmalonyl-COA mutase small subunit  25.9 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  28.25 
 
 		 719 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  27.55 
 
 		 589 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0013  methylmalonyl-CoA mutase  27.62 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  27.29 
 
 		 721 aa  134  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  26.87 
 
 		 718 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  26.64 
 
 		 712 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  26.21 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  26.93 
 
 		 709 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  26.74 
 
 		 709 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.1 
 
 		 713 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  32.7 
 
 		 716 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  26.93 
 
 		 709 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 714 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  26.64 
 
 		 712 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2039  methylmalonyl-CoA mutase  27.45 
 
 		 719 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  28.54 
 
 		 718 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  23.81 
 
 		 731 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05680  methylmalonyl-CoA mutase  26.57 
 
 		 726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5723  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.9 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.974466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1283  methylmalonyl-CoA mutase  26.37 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  33.88 
 
 		 740 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 733 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  31.72 
 
 		 720 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  26.67 
 
 		 714 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  24.79 
 
 		 731 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  25.79 
 
 		 740 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0214  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.74 
 
 		 557 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2096  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.47 
 
 		 588 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1622  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.45 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.02 
 
 		 706 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2026  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.47 
 
 		 588 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.81 
 
 		 724 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  32.41 
 
 		 716 aa  126  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  31.34 
 
 		 720 aa  126  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  31.72 
 
 		 712 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>