More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4374 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 640 aa  1243    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  59.13 
 
 		 614 aa  631  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  52.6 
 
 		 630 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  53.46 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  52.29 
 
 		 660 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  52.63 
 
 		 653 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  54.59 
 
 		 601 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  53.86 
 
 		 593 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  51.94 
 
 		 622 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  48.72 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  38.89 
 
 		 621 aa  351  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  42.14 
 
 		 615 aa  343  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  42.23 
 
 		 615 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  42.23 
 
 		 615 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  45.16 
 
 		 698 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  42.07 
 
 		 623 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  36.69 
 
 		 623 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  40.8 
 
 		 612 aa  320  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.55 
 
 		 626 aa  319  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  40.97 
 
 		 652 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  38.45 
 
 		 629 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.01 
 
 		 620 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.31 
 
 		 682 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  42.05 
 
 		 611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  43.89 
 
 		 569 aa  302  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  37.37 
 
 		 621 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.07 
 
 		 681 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  38.5 
 
 		 623 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  37.86 
 
 		 623 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  39.44 
 
 		 605 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  37.43 
 
 		 639 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  38.51 
 
 		 710 aa  286  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  38.98 
 
 		 605 aa  286  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  37.73 
 
 		 629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  39.1 
 
 		 605 aa  280  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  38.94 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  46.79 
 
 		 600 aa  277  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  38.04 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  38.04 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.45 
 
 		 618 aa  261  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.51 
 
 		 720 aa  257  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.89 
 
 		 723 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  30.5 
 
 		 684 aa  244  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  36.8 
 
 		 621 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  42.22 
 
 		 624 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  36.71 
 
 		 489 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.4 
 
 		 727 aa  194  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  29.36 
 
 		 604 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  29.69 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.06 
 
 		 706 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  29.06 
 
 		 706 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  29.22 
 
 		 718 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  30.4 
 
 		 738 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  29.56 
 
 		 722 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  30.48 
 
 		 714 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  28.81 
 
 		 723 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  29.76 
 
 		 712 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  30.89 
 
 		 714 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  27.9 
 
 		 719 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  30.56 
 
 		 709 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  30.35 
 
 		 712 aa  179  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  30.56 
 
 		 709 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  29.57 
 
 		 709 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  30.61 
 
 		 712 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 720 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  30.83 
 
 		 717 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  35.31 
 
 		 480 aa  177  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  31.63 
 
 		 712 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  30.21 
 
 		 712 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  30.27 
 
 		 718 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  29.47 
 
 		 714 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  29.1 
 
 		 714 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  27.03 
 
 		 589 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  29.18 
 
 		 714 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  29.67 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  29.27 
 
 		 714 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  29.27 
 
 		 714 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  29.27 
 
 		 714 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.27 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  30.43 
 
 		 722 aa  171  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  29.27 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  30.18 
 
 		 716 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  28.66 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.27 
 
 		 713 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  32.5 
 
 		 754 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  29.28 
 
 		 721 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  30.65 
 
 		 714 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  31.8 
 
 		 715 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  29.09 
 
 		 740 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.52 
 
 		 738 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  30.3 
 
 		 712 aa  167  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.93 
 
 		 1106 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  29.05 
 
 		 719 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2481  methylmalonyl-CoA mutase  31.1 
 
 		 565 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  34.83 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  28.73 
 
 		 720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  29.56 
 
 		 709 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  31.32 
 
 		 714 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  28.73 
 
 		 716 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>