More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3187 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  56.82 
 
 		 614 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 633 aa  1231    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  61.32 
 
 		 601 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  54.62 
 
 		 593 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  53.9 
 
 		 653 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  53.09 
 
 		 660 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  53.31 
 
 		 640 aa  548  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  51.36 
 
 		 630 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  50.67 
 
 		 622 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  48.62 
 
 		 644 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  40.47 
 
 		 698 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  39.62 
 
 		 621 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  40.31 
 
 		 615 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  40.15 
 
 		 615 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  40.15 
 
 		 615 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  41.73 
 
 		 620 aa  336  9e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  41.06 
 
 		 612 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  41.01 
 
 		 626 aa  329  9e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  39.28 
 
 		 623 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  41.31 
 
 		 611 aa  316  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  41.41 
 
 		 623 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  38.67 
 
 		 629 aa  313  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  39.26 
 
 		 652 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  39.37 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  38.09 
 
 		 623 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  39.43 
 
 		 605 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  39.19 
 
 		 597 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  39.39 
 
 		 639 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  39.43 
 
 		 623 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  39.61 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  40.49 
 
 		 605 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.38 
 
 		 713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  40.49 
 
 		 605 aa  286  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  50.73 
 
 		 569 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.79 
 
 		 682 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  38.99 
 
 		 610 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.26 
 
 		 681 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  37.3 
 
 		 710 aa  265  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  44.59 
 
 		 600 aa  253  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  29.82 
 
 		 618 aa  239  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  35.59 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  33.97 
 
 		 684 aa  236  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.57 
 
 		 723 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.19 
 
 		 720 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  40.38 
 
 		 624 aa  228  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.03 
 
 		 727 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  34.92 
 
 		 489 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.71 
 
 		 738 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  30.02 
 
 		 716 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  29.31 
 
 		 738 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.12 
 
 		 706 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  29.82 
 
 		 718 aa  177  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  27.94 
 
 		 706 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  30.67 
 
 		 722 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  31.9 
 
 		 725 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  34.24 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  30.63 
 
 		 709 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  30.21 
 
 		 709 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  30.62 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  30.11 
 
 		 719 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  29.7 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  30.21 
 
 		 709 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  30.14 
 
 		 722 aa  171  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  34.98 
 
 		 715 aa  171  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  30.62 
 
 		 740 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  29.49 
 
 		 720 aa  171  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  29.63 
 
 		 723 aa  170  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2762  methylmalonyl-CoA mutase  30.33 
 
 		 740 aa  170  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2505  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.42 
 
 		 736 aa  170  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000422516  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  34.6 
 
 		 720 aa  170  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05680  methylmalonyl-CoA mutase  30.08 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  33.9 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3042  methylmalonyl-CoA mutase  36.36 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  29.28 
 
 		 731 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  29.45 
 
 		 718 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  35.57 
 
 		 714 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  30.38 
 
 		 718 aa  168  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  30.04 
 
 		 720 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  34.47 
 
 		 712 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  27.94 
 
 		 714 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  28.87 
 
 		 719 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  27.94 
 
 		 714 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  30.97 
 
 		 729 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  34.63 
 
 		 661 aa  166  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  28.33 
 
 		 714 aa  167  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  28.12 
 
 		 714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  28.12 
 
 		 714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  29.3 
 
 		 740 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  30.57 
 
 		 733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  28.12 
 
 		 714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  28.12 
 
 		 714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  28.12 
 
 		 714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  30.38 
 
 		 736 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.86 
 
 		 724 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  30.27 
 
 		 719 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  28.84 
 
 		 721 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0229  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.15 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  30.94 
 
 		 718 aa  164  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2481  methylmalonyl-CoA mutase  29.08 
 
 		 565 aa  163  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  29.6 
 
 		 712 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>