299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2104 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 597 aa  1168    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  47.22 
 
 		 623 aa  412  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  44.95 
 
 		 615 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  44.95 
 
 		 615 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  44.79 
 
 		 615 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  46.01 
 
 		 652 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  45.78 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  45.4 
 
 		 620 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  39.48 
 
 		 614 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  39.94 
 
 		 630 aa  307  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  41.15 
 
 		 593 aa  307  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  39.27 
 
 		 633 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  42.71 
 
 		 622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  35.53 
 
 		 698 aa  289  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  38.94 
 
 		 640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  39.58 
 
 		 644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  39.58 
 
 		 660 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  38.51 
 
 		 653 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  39.74 
 
 		 601 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  44.38 
 
 		 612 aa  246  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  40.28 
 
 		 621 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  36.31 
 
 		 629 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  42.66 
 
 		 600 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  33.23 
 
 		 639 aa  226  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  37.91 
 
 		 623 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  33.23 
 
 		 621 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  34.68 
 
 		 623 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  41.36 
 
 		 611 aa  216  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  26.83 
 
 		 684 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  41.74 
 
 		 605 aa  211  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  41.62 
 
 		 605 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  39.62 
 
 		 623 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  40.44 
 
 		 605 aa  203  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  38.98 
 
 		 629 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  33.98 
 
 		 710 aa  192  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.26 
 
 		 682 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  37.57 
 
 		 569 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  38.18 
 
 		 624 aa  180  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  27.53 
 
 		 618 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  26.66 
 
 		 681 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.68 
 
 		 723 aa  177  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  39.73 
 
 		 610 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  29.92 
 
 		 621 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.65 
 
 		 720 aa  170  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.05 
 
 		 713 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  35.71 
 
 		 712 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  28.93 
 
 		 709 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  29.21 
 
 		 709 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  32.83 
 
 		 712 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  32.81 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  32.31 
 
 		 712 aa  151  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  29.02 
 
 		 714 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  32.49 
 
 		 718 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  29.4 
 
 		 709 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  40.47 
 
 		 479 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  31.45 
 
 		 707 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  35.53 
 
 		 661 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  31.69 
 
 		 714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  30.79 
 
 		 712 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.51 
 
 		 1106 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  30.51 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  31.07 
 
 		 733 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  30.23 
 
 		 731 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  32.6 
 
 		 717 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  32.24 
 
 		 716 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  34.91 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  33.61 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  27.35 
 
 		 720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  32.49 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  33.19 
 
 		 714 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  33.19 
 
 		 714 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  33.19 
 
 		 714 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  33.19 
 
 		 714 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  33.19 
 
 		 714 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  33.19 
 
 		 714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  30.51 
 
 		 740 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  29.82 
 
 		 712 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  27.35 
 
 		 720 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.87 
 
 		 706 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.19 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  32.99 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  26.75 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  32.97 
 
 		 720 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  30.51 
 
 		 740 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  29.14 
 
 		 715 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  32.12 
 
 		 723 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  33.21 
 
 		 722 aa  138  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  32.19 
 
 		 731 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  29.79 
 
 		 721 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  27.92 
 
 		 604 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  27.24 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  33.09 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  28.17 
 
 		 711 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  31.86 
 
 		 719 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  29.84 
 
 		 714 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1222  methylmalonyl-CoA mutase N-terminal domain-containing protein  26.23 
 
 		 597 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  32.26 
 
 		 720 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  24.88 
 
 		 591 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  29.3 
 
 		 715 aa  134  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.66 
 
 		 724 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>