More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0869 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  55.41 
 
 		 591 aa  653    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0869  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 604 aa  1246    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  48.63 
 
 		 589 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1222  methylmalonyl-CoA mutase N-terminal domain-containing protein  49.09 
 
 		 597 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  49.07 
 
 		 588 aa  528  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  29.59 
 
 		 618 aa  260  5.0000000000000005e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  29.7 
 
 		 614 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6641  Methylmalonyl-CoA mutase  32.3 
 
 		 448 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.76 
 
 		 681 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.87 
 
 		 723 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.79 
 
 		 682 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  29.04 
 
 		 640 aa  190  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.73 
 
 		 1106 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  28.32 
 
 		 630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  29.5 
 
 		 621 aa  184  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  26.01 
 
 		 720 aa  183  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  26.35 
 
 		 698 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0013  methylmalonyl-CoA mutase  29.29 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.8 
 
 		 1081 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  23.96 
 
 		 684 aa  172  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  26.26 
 
 		 653 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  28.38 
 
 		 605 aa  170  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  28.46 
 
 		 623 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  27.91 
 
 		 621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  29 
 
 		 629 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  28.01 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  28.78 
 
 		 623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  29.83 
 
 		 644 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  26.82 
 
 		 660 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  28.09 
 
 		 623 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.55 
 
 		 706 aa  163  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  28.57 
 
 		 629 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  28.27 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  29.38 
 
 		 612 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  28.12 
 
 		 605 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  32.71 
 
 		 633 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  27.15 
 
 		 639 aa  156  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07140  methylmalonyl-COA mutase small subunit  27.45 
 
 		 448 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  34.44 
 
 		 712 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  28.45 
 
 		 712 aa  150  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  35.12 
 
 		 712 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  28.92 
 
 		 716 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  34.31 
 
 		 738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  28.21 
 
 		 611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  32.59 
 
 		 661 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  27.02 
 
 		 709 aa  147  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  30.31 
 
 		 593 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  28.47 
 
 		 622 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 624 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.19 
 
 		 727 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  30.49 
 
 		 722 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  33.22 
 
 		 714 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  32.85 
 
 		 712 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  27.02 
 
 		 712 aa  145  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  31.76 
 
 		 709 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  25.87 
 
 		 713 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  34.31 
 
 		 709 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6136  methylmalonyl-CoA mutase  32.06 
 
 		 717 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179109  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  28.43 
 
 		 621 aa  144  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  29.25 
 
 		 713 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  33.05 
 
 		 720 aa  143  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  33.05 
 
 		 720 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  32.74 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  31.02 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 723 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  33.47 
 
 		 718 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  29.19 
 
 		 715 aa  141  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  30.74 
 
 		 714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  29.8 
 
 		 720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  33.33 
 
 		 972 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  30.07 
 
 		 714 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  30.07 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  30.07 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  31.42 
 
 		 709 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  30.07 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  30.07 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  30.07 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.07 
 
 		 714 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  30.03 
 
 		 731 aa  140  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  30.28 
 
 		 714 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  29.35 
 
 		 716 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  28.02 
 
 		 724 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  30.75 
 
 		 615 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.61 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  30.75 
 
 		 615 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  30.27 
 
 		 720 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  32.64 
 
 		 719 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  30.75 
 
 		 615 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  27.92 
 
 		 597 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  30.74 
 
 		 715 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  29.75 
 
 		 712 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  29.86 
 
 		 718 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  29.95 
 
 		 712 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  30.09 
 
 		 740 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  29.48 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  30.14 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  27.79 
 
 		 723 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  30.58 
 
 		 721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>