More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5544 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2761  methylmalonyl-CoA mutase  61.49 
 
 		 630 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5544  Methylmalonyl-CoA mutase  100 
 
 		 644 aa  1241    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2506  Methylmalonyl-CoA mutase  54.98 
 
 		 614 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000082079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05670  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  51.86 
 
 		 622 aa  495  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6419  Methylmalonyl-CoA mutase  52.4 
 
 		 593 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1943  methylmalonyl-CoA mutase  49.53 
 
 		 653 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3006  methylmalonyl-CoA mutase  49 
 
 		 660 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.84067  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4374  Methylmalonyl-CoA mutase  49.13 
 
 		 640 aa  482  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3187  Methylmalonyl-CoA mutase  47.5 
 
 		 633 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800977  normal  0.217414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1921  methylmalonyl-CoA mutase  50.24 
 
 		 601 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00796016  normal  0.671948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2480  methylmalonyl-CoA mutase  41.61 
 
 		 698 aa  415  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3134  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  44.21 
 
 		 615 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3123  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  44.21 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3184  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  44.21 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2762  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  45.57 
 
 		 626 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11522  methylmalonyl-CoA mutase small subunit mutA  44.91 
 
 		 623 aa  364  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3023  methylmalonyl-CoA mutase small subunit (MCM-beta)  41.23 
 
 		 621 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3650  methylmalonyl-CoA mutase, beta subunit  43.37 
 
 		 620 aa  349  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1929  methylmalonyl-CoA mutase  40.22 
 
 		 623 aa  346  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2636  methylmalonyl-CoA mutase  41.69 
 
 		 629 aa  339  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2419  Methylmalonyl-CoA mutase  42.01 
 
 		 652 aa  337  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.751014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2236  methylmalonyl-CoA mutase  41.35 
 
 		 639 aa  335  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3135  methylmalonyl-CoA mutase  42.72 
 
 		 629 aa  333  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5425  methylmalonyl-CoA mutase  40.89 
 
 		 612 aa  328  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0217  methylmalonyl-CoA mutase  43.61 
 
 		 611 aa  324  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2388  methylmalonyl-CoA mutase  41.57 
 
 		 605 aa  316  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.55342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2345  Methylmalonyl-CoA mutase  42.54 
 
 		 605 aa  316  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2665  Methylmalonyl-CoA mutase  42.38 
 
 		 605 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1762  methylmalonyl-CoA mutase  39.5 
 
 		 621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2041  Methylmalonyl-CoA mutase  40.73 
 
 		 623 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2295  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.54 
 
 		 681 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3536  methylmalonyl-CoA mutase  40.54 
 
 		 623 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0287465  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2104  Methylmalonyl-CoA mutase  40.48 
 
 		 597 aa  296  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0278  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35 
 
 		 682 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4729  methylmalonyl-CoA mutase  40.65 
 
 		 610 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2200  methylmalonyl-CoA mutase  36.8 
 
 		 624 aa  276  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.53913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1348  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  31.19 
 
 		 713 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000457861  unclonable  0.00000004793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3545  methylmalonyl-CoA mutase  41.67 
 
 		 569 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3785  Methylmalonyl-CoA mutase  37.01 
 
 		 621 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.546238 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1984  Methylmalonyl-CoA mutase  30.02 
 
 		 684 aa  261  3e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611894  normal  0.0597183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22180  methylmalonyl-CoA mutase, N-terminal domain/subunit  38.07 
 
 		 710 aa  261  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0921601  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5167  Methylmalonyl-CoA mutase  42.95 
 
 		 600 aa  257  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3871  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.46 
 
 		 720 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.949138  normal  0.194963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0544  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.41 
 
 		 723 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3305  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  33.13 
 
 		 706 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1656  methylmalonyl-CoA mutase, small subunit  29.68 
 
 		 618 aa  232  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3629  methylmalonyl-CoA mutase  37.83 
 
 		 489 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1285  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  32.29 
 
 		 727 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.238431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0857  methylmalonyl-CoA mutase  35.55 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  29.93 
 
 		 716 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  30.45 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  29.8 
 
 		 714 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  30.51 
 
 		 722 aa  177  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4237  methylmalonyl-CoA mutase  29.96 
 
 		 712 aa  177  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1165  methylmalonyl-CoA mutase  26.61 
 
 		 589 aa  177  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  28.89 
 
 		 712 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  29.67 
 
 		 718 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  29.75 
 
 		 740 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  27.51 
 
 		 714 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  27.29 
 
 		 714 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  27.82 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  28.84 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1349  methylmalonyl-CoA mutase  30.35 
 
 		 733 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148615  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  27.68 
 
 		 714 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  28.28 
 
 		 738 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  27.47 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  27.47 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  27.47 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  27.47 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  27.47 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  27.87 
 
 		 722 aa  171  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  29.34 
 
 		 740 aa  170  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5545  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.63 
 
 		 738 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2001  methylmalonyl-CoA mutase  28.44 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3005  methylmalonyl-CoA mutase  30.72 
 
 		 754 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.598546  normal  0.356991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  27.69 
 
 		 719 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1944  methylmalonyl-CoA mutase  29.8 
 
 		 740 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.132442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5687  methylmalonyl-CoA mutase  29.26 
 
 		 712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1120  methylmalonyl-CoA mutase  32.86 
 
 		 480 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.170859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  27.15 
 
 		 723 aa  167  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  29.24 
 
 		 709 aa  167  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3538  methylmalonyl-CoA mutase  29.18 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.162308  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  27.58 
 
 		 720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  29.75 
 
 		 714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  28.6 
 
 		 731 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  27.58 
 
 		 720 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  28.36 
 
 		 709 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0856  methylmalonyl-CoA mutase  29.56 
 
 		 714 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  28.51 
 
 		 709 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  28.09 
 
 		 709 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  27.89 
 
 		 716 aa  164  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  29.98 
 
 		 725 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1291  methylmalonyl-CoA mutase  28.69 
 
 		 588 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  30.29 
 
 		 735 aa  163  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1168  Methylmalonyl-CoA mutase  27.23 
 
 		 591 aa  163  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.648096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  29.6 
 
 		 719 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3021  methylmalonyl-CoA mutase  29.95 
 
 		 718 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.954275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  29.05 
 
 		 720 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  25.86 
 
 		 715 aa  161  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  28.81 
 
 		 712 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>